科学家展示了,如何才能更好地识别和测量调控细胞行为的重要分子,这为癌症诊断,预测和监测的工具改善铺平道路。 |
一个人类淋巴细胞的电子显微镜图像。(图片来源:Triche博士/美国国家癌症研究所)
科学家展示了,如何才能更好地识别和测量调控细胞行为的重要分子,这为癌症诊断,预测和监测的工具改善铺平道路。
曼彻斯特癌症研究中心的一部分——设在曼彻斯特大学的英国癌症研究中心的曼彻斯特研究所和伦敦癌症研究所的研究人员观察了蛋白激酶,一种调控细胞功能的各个方面的分子。这项研究由生物技术与生物科学研究理事会(BBSRC)/辉瑞CASE奖学金和CRUK资助,发表于2014年8月24日的《Nature Methods》杂志上。
早期的工作表明,各种各样的蛋白激酶的突变或增加都有肿瘤的生长有关,并且这数十年来,研究人员已经研究开发靶向和阻止其活性的药物,以杀死癌细胞。可降低蛋白激酶的十种药物迄今已批准用于癌症患者的治疗。
这项研究的领导者克劳斯·约根森博士,之前是伦敦癌症研究所癌症生物学部门的组长,之后被任为英国癌症研究所(曼彻斯特)系统肿瘤学组组长,说:“蛋白激酶调节细胞如何沟通。当这些分子失调时,这相当于细胞的‘幻听’,从而导致它们的行为发生变化。医生需要一种方法来发现个别肿瘤激酶水平的变化,使他们可以看到它们对治疗的反应如何,并为患者匹配最适合他们的疗法。”
该小组研究200多种蛋白激酶的组成。他们采用一种被称为质谱法的技术,来开发一种既能识别又能测量生物样品中的各种激酶含量的方法,例如从肿瘤手术中取出的一部分。
“我们的新方法,可以精确地测量出样品中的蛋白激酶含量。这意味着我们可以监控肿瘤细胞行为,以及癌症患者中的肿瘤对不同疗法的反应如何。”(来源:生物帮)
原文摘要:
Systematic evaluation of quantotypic peptides for targeted analysis of the human kinome
Jonathan D Worboys, John Sinclair, Yinyin Yuan & Claus J?rgensen
In targeted proteomics it is critical that peptides are not only proteotypic but also accurately represent the level of the protein (quantotypic). Numerous approaches are used to identify proteotypic peptides, but quantotypic properties are rarely assessed. We show that measuring ratios of proteotypic peptides across biological samples can be used to empirically identify peptides with good quantotypic properties. We applied this technique to identify quantotypic peptides for 21% of the human kinome.